新世紀いんぱくつ。 : 時に、2015年。　使徒襲来が激化する、第3新東京市。　ニコニコ動画に新曲をアップロードする三人の少女の姿があった。　石井ハルカ、谷口イズミ、松沢アヤコ。　ニコ生で活動する、市立第壱中学校二年生の三人は、音楽ユニット「いんぱくつ。」として活動していたが、使徒の襲来に備えてアヤコが疎開する事となり、新曲「センチメンタルな予感」を最後に、解散する事になっていた。　それぞれの道を進むことになるハルカ、イズミ、アヤコ。　残されたハルカは、イズミに「ある提案」をする。　そして第3新東京市には